Logiciel d'analyse Nexus Copy Number™

de visualisationNGSmédical

Le logiciel Nexus Copy Number permet aux chercheurs d'analyser plusieurs types de données (biopuces, panels NGS, WES/WGS et données d'expression) à travers des cohortes de recherche pour obtenir une vue d'ensemble du génome. Révéler de nouvelles informations avec une simplicité incroyable grâce à une variété d'outils d'analyse et de visualisation avancés. Intégrer les données phénotypiques et génomiques pour découvrir des corrélations génétiques significatives. Associez un nombre illimité d'annotations ou d'attributs d'échantillons pour des analyses ultérieures. Utilisez l'outil de prédiction pour trouver des corrélations entre les attributs phénotypiques et les changements génomiques, effectuez des analyses de survie pour les échantillons de cancer (avec des diagrammes de Kaplan-Meir), ou stratifiez les échantillons en fonction des profils d'aberration et des phénotypes afin d'identifier les mutations pilotes. Nexus Copy Number permet d'effectuer des regroupements à l'aide de K-means ou de grappes hiérarchiques, avec la possibilité d'ajuster le nombre de grappes. Identifiez les termes de l'ontologie des gènes (GO) enrichis sur l'ensemble du génome à l'aide de GSEA ou trouvez des termes GO significativement surreprésentés dans des régions sélectionnées uniquement. Utiliser la fonction de concordance pour identifier les altérations génomiques cooccurrentes avec des modifications du nombre de copies, des régions LOH ou des petites mutations, et représenter ces relations dans un diagramme circulaire. Analysez et visualisez plusieurs échantillons en parallèle - aucune expertise en bioinformatique n'est requise. Nexus Copy Number vous offre des fonctions statistiques robustes et de riches graphiques interactifs, sans qu'il soit nécessaire d'avoir des connaissances en programmation graphique et statistique. Il s'agit d'une solution de bureau puissante (Windows ou Mac OS) permettant la visualisation et l'analyse de dizaines de milliers d'échantillons de haute densité en parallèle.