LIS d'analyse RiboPrinter® System

de gestion de donnéesde laboratoire

En plus de notre service de typage des souches, nous proposons le ribotypage automatisé pour la caractérisation bactérienne des isolats microbiens. Cette technologie basée sur des fragments utilise des enzymes de restriction pour cibler et couper des régions des gènes de l'ARN ribosomal (5S, 16S, 23S et la région d'espacement incluant le Glu-tRNA), générant une empreinte génétique qui est unique à l'organisme au niveau de la souche Le système Ribotyping regroupe les échantillons dont les modèles RiboPrint® présentent un degré de similarité déterminé. Ces modèles peuvent être générés antérieurement ou postérieurement et peuvent être utilisés pour déterminer le niveau de similarité entre les isolats dans le cadre d'un exercice de suivi et de tendance dans un programme de surveillance environnementale (SE). Notre équipe construit et maintient une bibliothèque personnalisée pour chaque client qui soumet des échantillons pour l'impression ribosomique. Chaque fois que le client soumet un nouvel échantillon, celui-ci est comparé à tous les échantillons précédents de sa bibliothèque personnalisée et affecté à un RiboGroup. Dans certains cas, le ribotypage automatisé peut être moins efficace que le typage des souches basé sur les séquences, car certaines espèces présentent une très faible diversité au sein de l'opéron d'ARN ribosomal analysé par le RiboPrinter®. Dans ces cas, les méthodes de caractérisation des souches bactériennes basées sur les séquences (SLST et MLST) peuvent fournir un niveau de discrimination et de répétabilité beaucoup plus élevé que le ribotypage automatisé et doivent être fortement considérées.