Logiciel pour séquençage NGS Mix²

de laboratoired'analyse

Estimation précise de la concentration des transcrits Détection précise de l'expression différentielle Reproductibilité exceptionnelle dans des conditions variables Temps d'exécution rapides et faible empreinte mémoire Logiciel d'analyse des données RNA-Seq Mix² Un outil logiciel pour l'estimation précise de la concentration d'ARN à partir des données RNA-Seq. Modèle Le biais de fragmentation dans l'ARN-Seq pose un sérieux défi à la quantification précise des isoformes de gènes. Mix² ne fait aucune hypothèse sur le biais de couverture mais ajuste pour chaque isoforme de gène un modèle de mélange aux données (Fig. 1). Mix² peut donc, par exemple, représenter avec précision le biais 5', comme le montre la Fig. 1 (a et b), alors que Cufflinks est limité à la distribution uniforme (Fig. 1c). Un outil logiciel pour l'estimation précise de la concentration d'ARN à partir de données RNA-Seq.