Compteur de colonies automatique PhenoBooth+

automatiséde paillassebasé sur l'image

Présentation
PhenoBooth+ est un compteur de colonies et analyseur d’images de boîtes de Pétri tout-en-un, conçu pour l’évaluation phénotypique en flux moyen à élevé des micro-organismes sur milieux solides. Il associe imagerie autofocus rapide, acquisition fluorescente multi-longueur d’onde et outils d’analyse pour accélérer l’identification des hits et simplifier la gestion des données.

Principales caractéristiques

• Imagerie automatisée des plaques avec autofocus pour capturer rapidement boîtes de Pétri et plaques au format SBS
• Imagerie fluorescente multi-longueur d’onde avec options d’émission/filtres sélectionnables (optimisé pour BFP, GFP, mCherry, mRuby)
• Filtrage avancé des colonies par taille, circularité, couleur, luminosité et valeurs RGB
• Fonction "Batch Analyse" pour appliquer des paramètres identiques sur plusieurs plaques
• Visualisations intégrées : courbes de croissance, cartes thermiques intra-plaque, boxplots inter-plaques et graphiques statistiques
• Normalisation intra-plaque et inter-plaque optionnelle pour corriger les effets de bord
• Utilisable en mode autonome pour projets à débit moyen ou intégré à des automates haut-débit (ex. ROTOR+) pour criblages à grande échelle

Fonctionnement

• Charger une boîte de Pétri ou une plaque SBS contenant des colonies
• Sélectionner la longueur d’onde / filtre d’émission puis lancer l’autofocus pour imager chaque plaque en quelques secondes
• Filtrer les colonies détectées selon les propriétés d’intérêt puis lancer 'Batch Analyse' pour traiter un lot
• Consulter les résultats via des visualisations interactives : survoler une colonie pour voir son identifiant et comparer les réplicats

Fluorescence et débit

• Configurations d’éclairage et de filtres optimisées pour les protéines fluorescentes courantes (BFP, GFP, mCherry, mRuby)
• Possibilité de criblage très haute densité sur agar (ex. : jusqu’à 6144 colonies par plaque SBS)

Visualisation et analyse des données

• Visualiser les paramètres de colonies au sein des plaques avec des cartes thermiques (taille, luminosité, circularité, rougeur et valeurs RGB)
• Comparer des conditions entre plaques avec des boxplots et graphiques statistiques
• Exporter des courbes de croissance et graphiques pour analyses downstream

Traitement par lots

• Définir et enregistrer des filtres pour taille, circularité, couleur ou luminosité et les appliquer à l’ensemble des plaques d’un lot
• Automatise les analyses répétitives pour réduire le temps de manipulation et l’utilisation de feuilles de calcul manuelles

Remarques supplémentaires
Flux de travail intégrés pour accélérer la détection des hits et comparer les tailles de colonies expérimentales et contrôle sans capture d’image manuelle laborieuse.

Caractéristiques techniques

• Model: PhenoBooth+
• Brand: Singer Instruments
• Modes d’imagerie : Champ clair et fluorescence (plusieurs longueurs d’onde/filtres sélectionnables)
• Cibles fluorescentes optimisées : BFP, GFP, mCherry, mRuby
• Exemple de débit : jusqu’à 6144 colonies par plaque SBS (criblage haute densité)
• Automatisation : Autofocus et imagerie rapide des plaques ; fonctionnalité d’analyse par lots
• Paramètres mesurés : taille, luminosité, circularité, rougeur, valeurs RGB
• Sorties de données : courbes de croissance, cartes thermiques intra-plaque, boxplots, graphiques statistiques, résultats exportables
• Compatibilité : Utilisable en standalone ou intégré aux systèmes haut-débit (ex. ROTOR+)
• Documentation : Brochure produit disponible (PDF)