L'ARN-seq unicellulaire permet aux chercheurs d'étudier comment les modèles d'expression génique varient au sein des populations cellulaires. Takara Bio a développé des outils robustes pour réaliser l'ARN-seq sur des cellules individuelles isolées dans le système de circuit fluidique intégré (IFC) de Fluidigm. La chimie SMARTer sensible de nos kits à très faible niveau d'entrée, associée à la capacité d'automatisation à haut débit du système C1 de Fluidigm, offre des perspectives de haute résolution pour l'analyse du transcriptome.
Nous proposons actuellement deux générations de kits mRNA-seq pour cellule unique pour le système Fluidigm C1 Single Cell Auto Prep. La version la plus récente, la trousse SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit pour le système Fluidigm C1, intègre les caractéristiques de notre trousse SMART-Seq v4 de pointe, y compris les technologies SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) et LNA (locked nucleic acid), qui sont collectivement désignées sous le nom de "chimie SMARTer-seq®". Ce kit surpasse les protocoles publiés et notre version précédente, le kit SMARTer Ultra Low RNA pour le système C1 de Fluidigm, en offrant une plus grande sensibilité, une meilleure reproductibilité et une meilleure représentation des gènes riches en GC et en AT. Le nouveau script pour l'utilisation de ce kit est pris en charge par l'IFC mRNA Seq et l'IFC Open App, et peut être téléchargé via le Fluidigm Script Hub.
Vue d'ensemble
Chimie améliorée basée sur la technologie SMART - La technologie LNA dans l'oligo SMART-Seq v4 et la chimie améliorée permettent d'obtenir de meilleures performances (plus grande sensibilité, plus grande reproductibilité et plus de gènes riches en GC détectés).
Construction de la librairie en 2 jours - Le protocole de synthèse de l'ADNc prend environ deux heures, suivi du script SMART-Seq v4 de huit heures sur l'instrument C1.
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