Données de référence consultables construites pour l'intégration de Nexus
Nexus DB est une ressource inestimable et est incluse dans tous les abonnements à Nexus Copy Number.
Caractéristiques et avantages
Conservez vos propres données
En tant qu'utilisateur de Nexus, vous pouvez utiliser NexusDB pour stocker vos propres données, en privé. Les données sont sécurisées hors site grâce à la plateforme AWS d'Amazon.
Données de référence
Recherche par gène ou région d'intérêt pour trouver rapidement des échantillons et des annotations cliniques, avec la possibilité de comparer les données générées par différentes plateformes aCGH, SNP array et NGS.
Données de référence dans la base de données Nexus
La possibilité de partager facilement vos propres données avec les personnes de votre choix et de collaborer à travers le monde.
Données disponibles dans Nexus DB
Génétique constitutionnelle
AGRE - Échange sur la recherche génétique en matière d'autisme. Toutes les données sont disponibles dans les deux constructions du génome HG18 et HG19.
ISCA/ICCG (dbVAR) - Base de données des variations structurelles (SV) des variantes génomiques avec annotations cliniques pour un large éventail de troubles génétiques constitutionnels.
Projet de référence Affymetrix CytoScan HD - 375 échantillons normaux utilisés pour créer le fichier de référence CytoScan HD
Cancer
TCGA Premier - données TCGA retraitées et traitées manuellement, ce qui a permis d'augmenter considérablement la fidélité et de réduire en conséquence le nombre d'appels faux positifs.
Les ensembles de données comprennent la leucémie myéloïde aiguë, le glioblastome (GBM), l'adénocarcinome du kyste séreux ovarien, le carcinome rénal à cellules claires, l'adénocarcinome du côlon, le carcinome squameux du poumon, et plus encore.
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