Kit de test du cancer du poumon AVENIO ctDNA V2

pour la recherchedu cancer colorectalpour cfDNA

Statut réglementaire
Pour la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins diagnostiques.

Présentation
Le AVENIO ctDNA Surveillance Kit V2 est un essai de recherche par biopsie liquidienne utilisant le séquençage de nouvelle génération (NGS), conçu et optimisé pour la surveillance longitudinale de la charge tumorale dans la recherche sur le cancer du poumon et le cancer colorectal. Le panel Surveillance permet l'identification, le profilage et le suivi des altérations génomiques sur un large ensemble de gènes et de régions liés au cancer. Le kit comprend les réactifs, le logiciel d'analyse et la bioinformatique nécessaires pour détecter les aberrations génomiques dans les tumeurs solides ; un Oncology Analysis Server est requis pour exécuter le pipeline bioinformatique.

Applications prévues

• Surveillance longitudinale de la charge tumorale (cancer du poumon, cancer colorectal)
• Profilage tumoral non invasif et suivi sériel
• Détection d'un large éventail de classes de mutations (SNV, indels, fusions, CNV)

Flux de travail (vue d'ensemble)

• Isoler l'ADN libre circulant (cfDNA) à partir du plasma (AVENIO cfDNA Isolation Kit V2)
• Préparer les banques de séquençage (AVENIO ctDNA Library Prep Kit V2)
• Effectuer l'enrichissement ciblé (AVENIO ctDNA Enrichment Kit V2)
• Utiliser l'un des panneaux AVENIO ctDNA (Targeted, Expanded, Surveillance) et l'AVENIO Post-Hybridization Kit V2
• Séquençage de l'ADN

Avantages principaux

• Performance analytique : La performance analytique est soutenue par des stratégies intégrées de suppression des erreurs numériques (iDES) combinant codes moléculaires et techniques in silico pour améliorer la détection de variants à faible fréquence.
• Flux de travail optimisé : Workflow de recherche de bout en bout d'environ cinq jours de l'extraction à l'analyse et au reporting.
• Couverture complète : Analyse d'un large panel de gènes et de classes de mutations dans un seul essai — couverture étendue pour la surveillance de la charge tumorale, le profilage et la détection de biomarqueurs de résistance.

Caractéristiques clés

• Gènes référencés par les directives NCCN : l'essai comprend des gènes référencés dans les lignes directrices de la U.S. National Comprehensive Cancer Network (NCCN).
• Toutes classes de mutations : un seul essai détecte SNV, indels, fusions et CNV.
• Solution complète : réactifs, pipeline bioinformatique et logiciel fournis dans le cadre de la solution AVENIO ctDNA Analysis Kits V2.

Performance analytique (résumé)
Classe de mutation | Limite rapportée / remarques sur la sensibilité
SNV : sensibilité rapportée à 0,5% AF (pour 50 ng d'ADN en entrée) — Sensibilité >99%, VPP >95%
Indels : sensibilité rapportée à 1,0% AF (pour 50 ng d'ADN en entrée) — Sensibilité >99%, VPP >99%
Fusions : sensibilité rapportée à 1,0% — Sensibilité >99%, VPP >99%
CNV : dépendant de l'échantillon ; le kit signale les CNV ERBB2, EGFR et MET ; performance dépend du type d'échantillon, de la quantité d'ADN en entrée, du contenu tumoral et du nombre de copies génomiques (spécificité CNV rapportée VPP >99% dans l'étude technique).

Remarques sur la sensibilité et les entrées
Les métriques de sensibilité et de VPP rapportées réfèrent à la performance avec 50 ng d'ADN en entrée aux fréquences d'allèle indiquées. Le kit peut rapporter des variants jusqu'à 0,1% AF (avec sensibilité réduite) et permettre la préparation de banques avec aussi peu que 10 ng en entrée. Les performances indiquées requièrent une profondeur de séquençage suffisante (ex. ~40 millions de lectures par échantillon pour les panneaux AVENIO ctDNA V2) et le séquençage sur des instruments Illumina compatibles en mode Research Use Only.

Téléchargements et documentation (disponibles)
Liste des gènes, brochure logicielle et brochure produit sont fournis en tant que documents techniques associés au produit (PDF listés dans les téléchargements).