Adaptateur pour la biopharmacie KAPA Adapters

pour R&D

Vue d'ensemble
Les adaptateurs KAPA sont des adaptateurs de ligation pleine-longueur et tronqués pour la préparation de bibliothèques NGS d'ADN et d'ARN, compatibles avec les plates-formes de séquençage Illumina. Ils offrent une multiplexation flexible et limitent les erreurs d'affectation d'index grâce à des schémas d'indexation duale unique (UDI) et des options UMI, avec des configurations allant jusqu'à 384-plex.

Types d'adaptateurs

• Adaptateurs pleine-longueur : KAPA UDI Adapters — destinés aux préparations sans PCR ; fournissent des combinaisons d'index duale unique non redondantes, fournis à 15 µM.
• Adaptateurs tronqués : KAPA Universal Adapter et KAPA Universal UMI Adapter — permettent un plus grand nombre de combinaisons d'index et l'option UMI ; fournis à 15 µM (Universal) et 33 µM (Universal UMI).
• Mix de primers KAPA UDI : plaques de primers préformatées couvrant les jeux d'index 1–384 pour utilisation avec les adaptateurs Universal ; validés pour flux UMI et non-UMI.

Avantages clés

• Réduction des erreurs d'indexation : l'indexation duale unique permet d'éliminer les paires de codes-barres inattendues avant l'analyse, réduisant les artefacts d'index hopping.
• Contrôle qualité basé sur le séquençage et fabrication contrôlée pour minimiser les contaminations croisées de codes‑barres.
• Conversion uniforme selon les méthodes de fragmentation (Covaris et fragmentation enzymatique) pour des performances de bibliothèque robustes.
• Compatibilité avec les workflows WGS humains sans PCR lorsqu'utilisés avec les kits KAPA EvoPrep et KAPA EvoPlus V2.
• Multiplexation flexible de bas à haut niveau (jusqu'à 384-plex) selon la configuration adaptateur / mix de primers.

Utilisation recommandée

• Construction de bibliothèques NGS par ligation pour ADN et ARN.
• Préparations de bibliothèques sans PCR avec KAPA UDI Adapters et kits KAPA validés.
• Projets de séquençage haut débit nécessitant une atténuation de l'index hopping et un démultiplexage d'échantillons fiable.

Comparatif des adaptateurs KAPA (résumé)
Nombre d'UDIs : 96 (KAPA UDI Adapters) / 384 (KAPA Universal Adapter / KAPA Universal UMI Adapter)
Nombre de codes-barres P5 + P7 non redondants 8 nt : 96+96 / 384+384 / 384+384
Codes-barres identiques aux adaptateurs fournis par Illumina : Non / Non / Non
Recommandé pour instruments Illumina (flow cells patterned ou non) : Oui / Oui / Oui
Préparation sans PCR (marquage moléculaire) : Non / Non / Non
Validé pour KAPA EvoPrep Kit, KAPA EvoPlus V2 Kit : Validé / Compatible / Compatible
Validé pour KAPA RNA EvoPrep Kit : Validé / Validé / Compatible
Compatible avec KAPA Universal Enhancing Oligos : Oui / Oui / Oui
Formulation des adaptateurs : Pleine-longueur prêt à l'emploi 15 µM (4 réactions/adaptateur) / Tronqué prêt à l'emploi 15 µM (1 réaction/adaptateur) / Tronqué prêt à l'emploi 33 µM (1 réaction/adaptateur)
Configuration du kit : Plaque rigide 96 puits avec étiquetage adapté à l'automatisation, surremplis et scellages de remplacement (KAPA UDI Adapters) / Tubes adaptateurs et plaques 96 puits de mix de primers avec étiquetage adapté à l'automatisation et surremplis (variantes Universal/UMI)
Buffer de dilution d'adaptateur KAPA inclus : Oui (25 mL par kit KAPA UDI) / Non inclus pour adaptateurs tronqués

Performances et notes QC

• Des essais QC internes basés sur le séquençage évaluent la contamination croisée des codes-barres en liguant chaque UDI à un insert synthétique unique, en poolant et en séquençant les bibliothèques, puis en analysant la distribution des lectures par paire code-barres/insert.
• Les UDI non redondants réduisent sensiblement les contaminations apparentes attribuables à l'index hopping par rapport à l'indexation simple.
• Les données internes montrent des taux de contamination réduits et une conversion/couverture uniforme par rapport à d'autres méthodes de préparation de bibliothèques.

Caractéristiques / spécifications techniques

• Famille de produits : adaptateurs KAPA et accessoires.
• Options d'adaptateurs : KAPA UDI Adapters (pleine-longueur, 15 µM), KAPA Universal Adapter (tronqué, 15 µM), KAPA Universal UMI Adapter (tronqué, 33 µM).
• Combinaisons UDI : 96 (KAPA UDI Adapters) ou jusqu'à 384 (Universal / UMI avec mix de primers).
• Format de codes-barres : P5 + P7 non redondants de 8 nt.
• Configuration des kits : plaques rigides 96 puits et tubes adaptateurs avec étiquetage adapté à l'automatisation et surremplis lorsque applicable.
• Consommables inclus : Buffer de dilution d'adaptateur KAPA (25 mL) inclus avec les kits KAPA UDI ; non inclus avec adaptateurs tronqués.
• Instruments prévus : instruments de séquençage Illumina (flow cells patterned et non-patterned).
• Applications validées : préparation de bibliothèques NGS ADN et ARN ; WGS humain sans PCR lorsqu'utilisé avec KAPA EvoPrep / KAPA EvoPlus V2 ; compatibilité RNA EvoPrep selon indications.