Améliorez la précision et le débit grâce aux adaptateurs et accessoires KAPA
Dans le cadre du séquençage de nouvelle génération (NGS), l’utilisation d’adaptateurs indexés pour marquer les échantillons permet d’augmenter considérablement l’efficacité. Ce processus, appelé « multiplexage », permet de regrouper plusieurs échantillons au cours d’un même cycle de séquençage ; les lectures obtenues sont ensuite triées par des méthodes bioinformatiques.
Cependant, certains séquenceurs à haut débit sont sujets à des erreurs d’attribution d’index (index hopping), ce qui peut nuire à la qualité des données. Les stratégies d’indexation double unique (UDI) permettent d’atténuer l’impact de ces événements.
Roche propose deux types d’adaptateurs KAPA :
Adaptateurs pleine longueur : pour une préparation d’échantillons sans PCR avec jusqu’à 96 combinaisons d’index
Adaptateurs KAPA UDI
Aperçu des avantages
De faibles taux d’erreurs d’attribution renforcent la fiabilité des résultats
L'erreur d'attribution d'index lors du séquençage multiplexé peut résulter de plusieurs facteurs, notamment :
Le saut d'index
La contamination croisée des codes-barres ou des échantillons
Le changement de matrice lors de l'amplification par PCR d'échantillons regroupés
Les erreurs de séquençage ou d'analyse
Certains de ces problèmes peuvent être atténués grâce à une conception minutieuse des adaptateurs et à un contrôle qualité rigoureux.
Les adaptateurs KAPA UDI sont conçus pour garantir des résultats fiables grâce à :
Des combinaisons uniques à double index qui permettent de filtrer les lectures présentant des combinaisons de codes-barres inattendues avant l’analyse des données
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