Kit de test pour mutations génétiques AVENIO Targeted V2

pour détection de tumeurspour la recherched'oncologie

Présentation Le AVENIO Tumor Tissue Targeted Kit V2 est un test de séquençage nouvelle génération (NGS) réservé à un usage de recherche pour le profilage génomique des tumeurs solides à partir d'échantillons de tissu inclus en paraffine fixés au formol (FFPE). Il contient 17 biomarqueurs alignés sur les recommandations et utilise un flux de travail par hybridation-capture pour profiler l'ADN dérivé de tissu tumoral FFPE. Le kit prend en charge les workflows uniquement ADN pour détecter SNV, indels, CNV et fusions.

Panneaux inclus / options

• AVENIO Tumor Targeted Panel V2 — 17 gènes
• AVENIO Tumor Expanded Panel V2 — 77 gènes
• AVENIO Tumor Surveillance Panel V2 — 197 gènes

Avantages clés

• Biomarqueurs conformes aux recommandations (y compris ceux listés dans les guidelines NCCN) pour le profilage tumoral.
• Concordance analytique avec AVENIO ctDNA Targeted Kit V2 — contenu des panels apparié pour permettre une analyse alignée tissu/plasma.
• Solution de recherche complète : réactifs pour l'isolement de l'ADN à partir de tissu, la préparation de bibliothèques et l'enrichissement par hybridation-capture fournis dans les AVENIO Tumor Tissue Analysis Kits V2.
• Workflow de recherche bout en bout rationalisé — environ cinq jours de l'extraction à l'analyse et au rapport.

Performance analytique (résumé) Le kit offre de bonnes performances analytiques soutenues par la suppression enzymatique des erreurs et des codes-barres moléculaires.
Classes de mutations couvertes : SNV, Indels, Fusions, CNV.
Seuil de détection rapporté (exemple) : 5% pour SNV, Indels et Fusions.
Métriques de sensibilité et de valeur prédictive positive (PPV) rapportées : >99% (métriques dépendant du panel et du variant).
Spécificité par base : >99.99% sur les panels (performances nécessitant la profondeur de séquençage et les conditions d'échantillon recommandées).
Détection CNV : signale ERBB2, EGFR et MET ; la performance CNV dépend de l'échantillon (ex. détection à ~4,5 copies dans une étude technique avec 50 ng d'entrée).

Usage prévu et flux de travail

• Research Use Only (RUO) — non destiné à un usage diagnostique.
• Destiné au profilage génomique des tumeurs solides à partir d'ADN dérivé de tissu FFPE.
• Entrée ADN : typiquement ≥20 ng d'ADN FFPE (contrôle qualité d'entrée requis et quantité totale déterminée par ce contrôle).
• Débit : réactifs suffisants pour traiter jusqu'à 24 réactions (résultats rapportables) lors d'une seule exécution de séquençage sur un instrument Illumina NextSeq 500/550/550Dx (mode Research Use Only).
• Exigences de séquençage : les performances indiquées nécessitent la profondeur de séquençage recommandée (ex. ≥20 millions de lectures par échantillon pour les kits Targeted, Expanded et Surveillance V2).

Avantages en un coup d'œil

• Contenu du panel exactement apparié à AVENIO ctDNA Targeted Kit V2 permettant la concordance tissu/plasma pour les études associant tissu et plasma.
• Workflow rationalisé réduisant le temps de résultat et la complexité opérationnelle.
• Solution de recherche complète avec réactifs, capacités d'analyse et de reporting pour soutenir la recherche oncologique NGS en interne.

Notes techniques supplémentaires

• Flux de travail d'enrichissement basé sur l'hybridation-capture.
• Workflow uniquement ADN (ARN non requis pour les classes de mutations rapportées).
• Les métriques de performance analytique (sensibilité, PPV, spécificité) dépendent du type d'échantillon, de l'entrée ADN, du pourcentage de cellules tumorales, de la profondeur de séquençage et des caractéristiques génomiques de la tumeur.

Caractéristiques / spécifications techniques

• Denomination commerciale : AVENIO Tumor Tissue Targeted Kit V2
• Famille de produits : AVENIO (tests NGS en oncologie)
• Échantillons prévus : tissu tumoral FFPE (rouleaux/coupes)
• Exigence d'entrée ADN : ≥20 ng ADN FFPE (le contrôle qualité d'entrée détermine la quantité totale)
• Taille du panel (Targeted) : 17 gènes (≈81 kb)
• Options de panel disponibles : Targeted (17 gènes), Expanded (77 gènes), Surveillance (197 gènes)
• Classes de mutations détectées : SNV, Indels, Fusions, CNV (workflow uniquement ADN)
• Seuil de détection analytique exemple : 5% d'allèle mutant pour SNV, Indels et Fusions
• Sensibilité / PPV : rapporté >99% pour les classes de mutations clés (dépend du panel et du variant)
• Spécificité par base : rapportée >99.99% sur les panels (avec profondeur de séquençage requise)
• Rapport CNV : ERBB2, EGFR, MET (performance dépend de l'échantillon et de l'entrée ; exemple de détection à ~4,5 copies dans une étude technique)
• Débit par kit : jusqu'à 24 résultats rapportables par kit / exécution de séquençage
• Instrument de séquençage recommandé : Illumina NextSeq 500/550/550Dx (mode Research Use Only)
• Temps typique jusqu'au résultat : workflow rationalisé < 5 jours de l'extraction de l'ADN tissulaire au rapport final (dépend du workflow)
• Inclus : réactifs pour l'isolement de l'ADN à partir de tissu FFPE, préparation de bibliothèques et enrichissement par hybridation-capture suffisants pour jusqu'à 24 réactions
• Réglementation/avertissement : For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.