Milieu réactionnel KAPA HyperCap

solution tamponà billes magnétiquespour oncologie

Présentation Les panneaux fixes (catalogue) KAPA HyperCap et leurs kits associés proposent des solutions prêtes à l'emploi pour l'enrichissement ciblé par hybridation dans les workflows de recherche (Pour recherche uniquement, RUO). Ils associent expertise en conception de sondes et contrôle de fabrication pour garantir une qualité de lot cohérente et une efficacité de séquençage élevée pour les applications oncologie et maladies héréditaires.

Panneau KAPA HyperCap Oncologie Le panneau Oncologie est une cible de capture d'environ 214 Kb couvrant les séquences codantes complètes de 13 gènes somatiques (ATM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CHEK2, EGFR, ERBB2, KRAS, MET, MYCN, RAD51C, RAD51D, TP53) ainsi que des hotspots sur ~69 gènes additionnels. Il est optimisé pour des types d'échantillons difficiles (FFPET/FFPE et cfDNA) avec un réglage pour une uniformité et une spécificité élevées. Exemples de performances rapportées : >94% des positions sans erreur sur ADN FFPET de faible quantité/qualité et métriques de couverture profonde élevées (uniformité : >92% des bases dans 0,5x–2x de la médiane ; >88% des bases exoniques couvertes >300x).

Panneau KAPA HyperCap Hérédité Le panneau Hérédité cible environ 10 Mb et couvre 3 332 gènes associés à la recherche sur les maladies héréditaires, incluant les variantes pathogènes/probablement pathogènes de ClinVar. Il est conçu pour l'efficacité de séquençage avec une uniformité optimisée et de faibles taux de duplication, offrant une forte couverture de la cible (ex. : 98,5% des bases cibles couvertes à 30x ; couverture moyenne ~92,6x). Le contrôle qualité des sondes par lot assure une performance stable.

Avantages principaux

• Qualité et efficacité de séquençage élevées pour FFPET et cfDNA grâce à une conception et une fabrication optimisées des sondes.
• Workflows KAPA HyperCap compatibles automatisation : KAPA HyperPrep, KAPA HyperPlus et KAPA Universal UMI Adapters ; prise en charge du multiplexage pré-capture pour augmenter le débit.
• Contenu ciblé : panneau oncologie pour gènes somatiques et hotspots essentiels ; panneau hérédité pour des milliers de gènes liés aux maladies héréditaires et contenu ClinVar pour la recherche germinale.
• Disponibilité en stock en tant que panneaux et kits catalogue avec QC NGS des sondes par lot.

Exemples d'articles catalogue sélectionnés (numéro de matériel — description — EAN) KAPA HyperCapture Reagent Kit, 24 rxn — 07613336198186
KAPA HyperCapture Reagent Kit, 96 rxn — 07613336198179
KAPA HyperCapture Reagent V2 Kit, 24 rxn — 07613336242315
KAPA HyperCapture Reagent V2 Kit, 96 rxn — 07613336242322
KAPA HyperCap Heredity panel, 24 rxn — 07613336188408
KAPA HyperCap Heredity panel, 48 rxn — 07613336188415
KAPA HyperCap Heredity panel, 96 rxn — 07613336188422
KAPA HyperCap Heredity panel, 192 rxn — 07613336188439
KAPA HyperCap Oncology panel, 12 rxn — 07613336188361
KAPA HyperCap Oncology panel, 24 rxn — 07613336188378
KAPA HyperCap Oncology panel, 48 rxn — 07613336188385
KAPA HyperCapture Bead Kit, 24 rxn — 07613336198209
KAPA HyperCapture Bead Kit, 96 rxn — 07613336198193
KAPA Universal Enhancing Oligos, 24 rxn — 07613336198162
KAPA Universal Enhancing Oligos, 96 rxn — 07613336198155

Notes de performance et workflow Les synthèses de validation incluent des performances sur workflows ADN FFPET (KAPA HyperCap FFPET DNA Workflow), workflows cfDNA (KAPA HyperCap cfDNA Workflow) et approches de capture en échantillon unique et multiplexées. Exemples d'entrées de validation : 10 ng ADN FFPE, 10 ng cfDNA, 100 ng ADN génomique pour multiplexage pré-capture. Les métriques rapportées comprennent pourcentage on-target, fold-80 base penalty, taux de duplication PCR, pourcentage de bases couvertes à des profondeurs données (ex. >=30x) et comptes médians de lectures après déduplication UMI.

Caractéristiques techniques

• Usage réglementaire : Pour recherche uniquement (RUO). Non destiné à un usage diagnostique.
• Famille de produits : Panneaux catalogue KAPA HyperCap et kits associés (réactifs, kits de billes, tampons de resuspension, oligos d'amélioration, etc.).
• Taille des cibles : Oncologie ~214 Kb (13 gènes CDS complets + contenu hotspot) ; Hérédité ~10 Mb (3 332 gènes + contenu ClinVar).
• Compatibilité échantillons : FFPET/FFPE, ADN circulant libre (cfDNA), ADN génomique (gDNA).
• Entrées validées typiques : 10 ng ADN FFPE ; 10 ng cfDNA ; 100 ng gDNA pour workflows multiplexés pré-capture.
• Métriques clés : Ex. Oncologie — >94% positions sans erreur ; >92% bases dans 0,5x–2x médiane ; >88% bases exoniques >300x. Ex. Hérédité — 80,9% lectures on-target ; fold-80 penalty 1,42 ; duplication PCR 2,2% ; 98,5% des bases cibles à 30x ; couverture moyenne ~92,6x.
• Compatibilité workflow : Workflows KAPA HyperCap incluant KAPA HyperPrep, KAPA HyperPlus, KAPA EvoPrep Boost / EvoPlus Boost ; prise en charge d'adaptateurs UMI et stratégies single-library ou multiplexées pré-capture.
• Contrôle qualité : QC des sondes NGS réalisé sur chaque lot pour garantir la cohérence.
• Disponibilité : Panneaux et kits catalogue en stock ; plusieurs formats de conditionnement / nombres de réactions (ex. : 12, 24, 48, 96, 192, 384 réactions selon l'article).