Kit de test pour l'analyse pan-cancéreuse AVENIO Surveillance V2

pour la recherche médicalepour détection de tumeurspour cancers

Aperçu
Les kits AVENIO Tumor Tissue Analysis V2 contiennent les réactifs nécessaires pour isoler l'ADN de tissus inclus en paraffine (FFPE), préparer des bibliothèques de séquençage et enrichir des régions cibles selon trois options de panel :

• AVENIO Tumor Targeted Panel V2 — 17 gènes
• AVENIO Tumor Expanded Panel V2 — 77 gènes
• AVENIO Tumor Surveillance Panel V2 — 197 gènes

Ces kits prêts à l'emploi utilisent un flux de travail DNA-only basé sur la capture hybride pour profiler les altérations génomiques à partir de tissus tumoraux solides FFPE. Les kits permettent l'analyse des quatre classes de mutations (SNV, indels, CNV et fusions) en utilisant uniquement l'ADN et comprennent des réactifs pour traiter jusqu'à 24 résultats exploitables par run de séquençage sur Illumina NextSeq 500/550/550Dx (mode Research Use Only).

Avantages clés

• Analyse alignée tissu/plasma avec l'AVENIO ctDNA Surveillance Kit V2 — contenu de panel et flux de travail de capture hybride identiques pour faciliter l'établissement d'une ligne de base et l'analyse de concordance entre tissu et plasma.
• Flux de travail de recherche simplifié de bout en bout — extraction à l'analyse en environ cinq jours couvrant SNV, indels, fusions et CNV dans un seul flux ADN.
• Solution de recherche complète — réactifs pour isolation d'ADN, préparation de bibliothèques et enrichissement ciblé, combinés à l'analytique et au reporting pour soutenir les workflows NGS oncologiques internes.

Performances analytiques (points clés)
Classes de mutations et fréquence allélique / nombre de copies : SNV — 5% MAF ; Indels — 5% MAF ; Fusions — 5% MAF ; CNV — dépendant de l'échantillon.
Sensibilité et PPV par variant rapportées >99% pour SNV, indels et fusions aux fréquences allélique indiquées ; spécificité CNV élevée (PPV >99%) dans l'étude technique ; ERBB2 et MET détectés à ~4,5 copies dans l'échantillon de validation.
Notes de performance : les performances déclarées exigent ≥20 millions de lectures par échantillon pour les kits Targeted, Expanded et Surveillance V2 ; sensibilité déterminée à l'aide d'échantillons de référence vérifiés ; performance SNV panel-wide ; performances indel et fusion rapportées sur variants de whitelist.

Usage prévu / Clause réglementaire
Réservé à la recherche. Ne pas utiliser en procédures diagnostiques.

Caractéristiques / spécifications techniques

• Panels disponibles : Targeted (17 gènes), Expanded (77 gènes), Surveillance (197 gènes)
• Flux de travail : enrichment par capture hybride ; workflow ADN uniquement
• Type d'échantillon : rouleaux/lamelles FFPE (tissu fixé au formol et inclus en paraffine)
• Apport ADN minimal : ≥20 ng d'ADN FFPET (dépendant de l'échantillon et du kit)
• Débit : réactifs pour traiter jusqu'à 24 résultats exploitables par kit (par run de séquençage)
• Plateforme de séquençage : Illumina NextSeq 500 / 550 / 550Dx (mode Research Use Only)
• Classes de mutations couvertes : SNV, indels, fusions, CNV
• Sensibilité analytique / PPV : >99% rapporté pour SNV/indels/fusions à 5% MAF (dépendant du variant et du panel)
• Détection CNV : signale ERBB2, EGFR et MET ; performance CNV dépend de l'échantillon (facteurs : quantité d'ADN, fraction tumorale, type d'échantillon)
• Exigence de profondeur de lecture : performances déclarées exigent ≥20 millions de lectures par échantillon
• Applications prévues : profilage tumoral, suivi de la charge tumorale, établissement de la ligne de base pour suivi longitudinal, investigation de biomarqueurs de résistance, applications de recherche sur la maladie résiduelle minimale (MRD)