Kit de test de diagnostic cobas®

pour COVID-19de maladies respiratoirespour infections respiratoires

Présentation
cobas® Respiratory flex est un test automatisé, multiplex et qualitatif d'acide nucléique destiné aux systèmes cobas® 5800/6800/8800. Il utilise la PCR en temps réel et la technologie TAGS (Temperature Activated Generation of Signal) de Roche pour permettre la détection et la différenciation simultanées de plusieurs cibles virales respiratoires dans un seul puits. L'essai fournit jusqu'à 12 résultats viraux plus un contrôle interne ARN par puits et est destiné à un usage diagnostic in vitro (IVD) sur échantillons d'écouvillons nasopharyngés prélevés chez des personnes présentant des signes et symptômes d'infection des voies respiratoires, en conjonction avec des éléments cliniques et épidémiologiques.

Indication clinique / Usage prévu
Détection qualitative et différenciation des acides nucléiques viraux respiratoires pour aider au diagnostic d'infection respiratoire lorsqu'il est utilisé avec des informations cliniques et épidémiologiques. Un résultat négatif n'exclut pas une infection ; un résultat positif n'écarte pas une co-infection et peut ne pas indiquer la cause définitive de la maladie. En raison de la similarité génétique entre le rhinovirus humain et l'entérovirus, le test ne peut pas toujours les différencier de manière fiable.

Principales caractéristiques et procédé

• Préparation d'échantillons entièrement automatisée (extraction et purification des acides nucléiques) suivie d'une amplification PCR et d'une détection sur les systèmes cobas® 5800/6800/8800.
• Extraction simultanée de l'acide nucléique et du contrôle interne ARN (RNA IC) ; l'acide nucléique est libéré par protéinase et réactif de lyse, lié à des billes de verre magnétiques, lavé et élué.
• La technologie TAGS permet la différenciation de plusieurs cibles par canal de fluorescence en combinant 5 canaux de fluorescence avec 3 canaux de détection thermique (T1, T2, T3), permettant la détection/différenciation jusqu'à 15 cibles par puits dans des implémentations futures et jusqu'à 12 résultats viraux respiratoires plus le RNA IC avec ce kit.
• Le mélange maître contient une ADN polymérase thermostable, des sondes TAGS et du dUTP ainsi que AmpErase (uracil-N-glycosylase) pour le contrôle des contaminations croisées.

Panel ciblé (cible — gène ciblé)
Cible — Gène ciblé
Influenza A — Matrix protein 1 (M1)
Influenza B — Non-structural protein NS-1/2 (NS1/NEP)
Respiratory Syncytial Virus (RSV) — Matrix protein (M)
SARS-CoV-2 — ORF1ab polyprotein and ORF1a polyprotein (ORF1ab / ORF1a)
Adenovirus (espèces B, E) — Terminal protein precursor (E2B)
Adenovirus (espèce C) — Capsid protein precursor (L3)
Human Metapneumovirus — Matrix protein (M)
Enterovirus / Rhinovirus — 5' untranslated region (5'UTR)
Coronavirus OC43 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus HKU1 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus 229E — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus NL63 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Human Parainfluenza Virus 1 — L polymerase protein (L)
Human Parainfluenza Virus 2 — Large protein (L)
Human Parainfluenza Virus 3 — Nucleocapsid protein (N)
Human Parainfluenza Virus 4 — Large protein (L)

Notes analytiques / opérationnelles

• Utilise des amorces spécifiques avant/arrière et des sondes marquées fluorescentes ; le signal des sondes TAGS nécessite un clivage par nucléase suivi d'une élévation de la température de réaction pour activer la fluorescence.
• La fluorescence est capturée sur plusieurs canaux de fluorescence et à trois températures définies par cycle pour permettre la différenciation multiplex.
• Les contrôles externes positifs et négatifs sont traités de la même manière que les échantillons patients.

Limites

• Les résultats négatifs n'excluent pas une infection respiratoire et ne doivent pas être utilisés seuls pour la prise en charge du patient.
• Les résultats positifs n'excluent pas les co-infections et l'agent détecté peut ne pas être la cause définitive de la maladie.
• Ne peut pas toujours distinguer de manière fiable le rhinovirus humain de l'entérovirus en raison de la similarité génétique.

Avantages / points clés

• Flexibilité pour sélectionner des cibles et obtenir des résultats supplémentaires (réflexe numérique) à partir du même kit/course.
• Permet de consolider plusieurs cibles respiratoires en une solution personnalisable sur les systèmes existants de la gamme cobas® x800 sans mises à niveau matérielles ou logicielles.
• Conçu pour simplifier la logistique de laboratoire, réduire les tests en double et soutenir un diagnostic PCR efficace avec des délais de rendu rapides.

Caractéristiques / spécifications techniques

• Cibles : Influenza A, Influenza B, RSV, SARS-CoV-2, adénovirus (B, C, E), metapneumovirus humain, entérovirus/rhinovirus, coronavirus humains courants (229E, HKU1, NL63, OC43), virus parainfluenza 1–4.
• Type d'échantillon : Écouvillons nasopharyngés collectés dans Copan UTM-RT® ou BD™ Universal Viral Transport (UVT) ou équivalent.
• Volume d'échantillon minimum : 0,4 mL.
• Technologie : PCR en temps réel avec multiplexage Roche TAGS (Temperature Activated Generation of Signal).
• Taille du kit : 192 tests par kit.
• Stabilité du kit ouvert : 90 jours avec 40 réutilisations.
• Contrôle interne : Contrôle interne ARN inclus et co-extrait.